Οι μαθητές συνήθως εισέρχονται στον Β/θμιο κύκλο σε ηλικία 11 χρονών και αφού ολοκληρώσουν επιτυχώς τον Α/θμιο κύκλο των Ευρωπαϊκών Σχολείων ή αντίστοιχο κύκλο σπουδών άλλου αναγνωρισμένου σχολικού συστήματος. 

Ο Β/θμιος κύκλος είναι επταετής και πιο συγκεκριμένα:

• τα πρώτα τρία χρόνια, τάξεις S1-S3, οι μαθητές έχουν κοινό πρόγραμμα σπουδών. Τα περισσότερα μαθήματα διδάσκονται στη μητρική γλώσσα (L1).
  • Στην τάξη S1, όλοι οι μαθητές ξεκινούν μια δεύτερη ξένη γλώσσα (L3), την οποία συνεχίζουν τουλάχιστον μέχρι και την S5.
  • Στην S2, οι μαθητές μπορούν να επιλέξουν Λατινικά ή Αρχαία Ελληνικά σαν συμπληρωματικά μαθήματα.
  • Στην S3, οι ανθρωπιστικές επιστήμες και η ηθική διδάσκονται πλέον στην πρώτη ξένη γλώσσα (L2). Οι μαθητές που επέλεξαν Λατινικά την προηγούμενη χρονιά συνεχίζουν το μάθημα, ενώ οι υπόλοιποι μπορούν να επιλέξουν το μάθημα της Τεχνολολογίας Πληροφοριών (ICT).

• ΣτIς τάξεις S4 και S5 το υποχρεωτικό μάθημα των Φυσικών Επιστημών χωρίζεται σε δύωρα μαθήματα Φυσικής, Χημείας και Βιολογίας, ενώ οι μαθητές μπορούν να επιλέξουν ανάμεσα σε κανονικά και προχωρημένα μαθηματικά. Άλλες επιλογές μαθημάτων είναι τα Οικονομικά στην L2, μια τρίτη ξένη γλώσσα (L4), Αρχαία Ελληνικά κλπ. Οι μαθητές πρέπει να αποφασίσουν για τις επιλογές μαθημάτων πρiν το τέλος της S3.

• Ο 6ος και 7ος χρόνος στον Β/θμιο κύκλο οδηγούν στο European Baccalaureate. Αν και υπάρχει ένας κορμός υποχρεωτικών μαθημάτων που συμπεριλαμβάνει τη μητρική γλώσσα και της πρώτη ξένη γλώσσα, τα Μαθηματικά, ένα μάθημα Φυσικών Επιστημών, τη Φιλοσοφία, τη Φυσική Αγωγή, την Ιστορία και τη Γεωγραφία, οι μαθητές διαθέτουν ένα ευρύ φάσμα άλλων επιλογών, ενώ μπορούν να επιλέξουν να διδαχθούν κάποια μαθήματα δύωρα, τετράωρα ή σε ανώτερο επίπεδο. Οι μαθητές πρέπει να αποφασίσουν για τις επιλογές μαθημάτων πρiν το τέλος της S5. Για περαιτέρω πληροφορίες μπορείτε να συμβουλευτείτε τη σελίδα του European Baccalaureate.

Οι μαθητές αξιολογούνται τακτικά και εκδίδονται έλεγχοι προόδου τέσσερις φορές ανά σχολικό έτος. Η αξιολόγηση βασίζεται τόσο στην εργασία μέσα στο μάθημα όσο και σε γραπτές δοκιμασίες, αν και στις τάξεις S1-S3 δεν υπάρχουν επίσημες εξετάσεις. Οι προϋποθέσεις προαγωγής των μαθητών στην επόμενη τάξη καθορίζονται από τον Γενικό Κανονισμό των Ευρωπαϊκών Σχολείων.